Efectores de Trichoderma harzianum con potencial actividad antimicrobiana

Resumen

Introducción. El uso intensivo de agroquímicos genera resistencia en fitopatógenos y efectos adversos sobre el ambiente y la salud humana. Como alternativa, los agentes de biocontrol como Trichoderma harzianum ganan relevancia por su capacidad antagonista y recientemente por sus proteínas efectoras. Este estudio se centra en la identificación in silico de efectores con potencial antimicrobiana y se selecciona al menos uno (Andrade-Hoyos et al., 2023; Ayaz et al., 2023). Objetivo. Caracterizar computacionalmente y analizar su expresión durante la interacción con Pseudocercospora fijiensis, expresarlo heterólogamente en E. coli y evaluar su actividad antimicrobiana in vitro. Métodos. La metodología empleó una estrategia mixta in silico e in vitro. A partir del genoma de T. harzianum y mediante los programas EffHunter y WideEffHunter, se identificaron posibles efectores que fueron evaluados con cuatro predictores de actividad antimicrobiana: AI4AMP, CAMP3, DRAMP y AMP Scanner v2. De este análisis se seleccionaron potenciales efectores antimicrobianos, en los cuales se analizó la presencia de motivos MYC en sus regiones promotoras. Paralelamente, se realizó una búsqueda de efectores con actividad antimicrobiana confirmada experimentalmente para identificar homólogos en T. harzianum (Carreón-Anguiano et al., 2020; 2023). Resultados y discusión. Se revelaron más de 5 000 posibles efectores en el genoma de T. harzianum. De estos, 34 mostraron potencial actividad antimicrobiana con base en los cuatro predictores utilizados. Se identificó, mediante homología, un posible efector antimicrobiano con actividad de ribotoxina, y se encontraron motivos MYC en regiones promotoras de genes relacionados con micoparasitismo. Conclusión. Se encontraron 34 efectores en el genoma de T. harzianum con potencial actividad microbiana