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AvAnces en InvestIgAcIón AgropecuArIA •
IV Simposio Internacional de Parasitología Agrícola. AIA. 2024. 28(Suplemento 1): 3-4
Issn-l 2683 1716
Avances en Investigación Agropecuaria 2024. 28(Suplemento 1): 3-4
ISSN- L 2683 1716
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
http://doi.org/10.53897/RevAIA.24.28.10
Digestión in silico para identificar especies
de Xyleborus (Curculionidae: Scolytinae) de
importancia agrícola
In silico Digestion to Identify Xyleborus Species (Curculionidae:
Scolytinae) of Agricultural Importance
Ricardo Alcocer Vázquez1 https://orcid.org/0009-0008-3777-0785
Kenzy Ivveth Peña Carrillo2* https://orcid.org/0000-0003-0580-6700
1Universidad Nacional Autónoma de México, 3er. Circuito exterior s/n, Cd. Universitaria, Copilco,
Coyoacán, A.P. 70-233, C.P. 04510, Ciudad de México.
2INIFAP, Campo Experimental General Terán, km 31 carretera Montemorelos-China, 67400, General
Terán, Nuevo León, México.
*Autor de correspondencia: pena.kenzy@inifap.gob.mx
Resumen
Introducción. El género Xyleborus contiene
especies de hábitos ambrosiales que se con-
sideran plagas potenciales de gran impacto
económico, debido a que afectan a una amplia
variedad de plantaciones naturales y agrícolas
del país. En México, el género Xyleborus está
representado por hasta 18 especies, cuya iden-
tificación se basa principalmente en caracteres
morfológicos, lo que dificulta las actividades de
control dentro de su área de distribución (Pérez-
De La Cruz et al., 2009). Xyleborus glabratus
es una especie que representa un peligro po-
tencial pues se le asocia el hongo Raffaelea
lauricola que causa una enfermedad mortal en
plantas de la familia Lauraceae (incluyendo el
aguacate); en México, se mantiene como espe-
cie cuarentenaria, sin embargo, se reportó en
el sur de EE UU afectando cultivos de agua-
cate y causando enormes pérdidas económicas
(Castrejón-Antonio et al., 2017). Objetivo.
Abstract
Introduction. The weevil genus Xyleborus
includes species with ambrosial habits, they
are a pestiferous species economically impor-
tant because they affect forest species and
agricultural plantations. In Mexico, Xyleborus
is represented by up to 18 species whose iden-
tification is mainly based on morphological
characters which complicates the management
activities within its distribution area (Pérez-De
La Cruz et al., 2009). The species Xyleborus
glabratus represents a potential risk as it vectors
the fungal symbiont Raffaelea lauricola wich is
lethal to members of the Lauraceae (including
avocados). In Mexico the species remains a
quarantine species, however, it has been repor-
ted in the south of the US where it has been
detrimental to avocado crops, resulting in sig-
nificant economic losses (Castrejón-Antonio
et al., 2017). Objective. To test the in silico
digestion (virtual) of sequences as a new tool
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Probar la digestión in silico (virtual) como una
nueva herramienta para identificar a las dife-
rentes especies Xyleborus presentes en el país.
Métodos. Se utilizaron secuencias de barco-
ding de especies de Xyleborus disponibles en
bases de datos en línea fueron descargadas,
dichas secuencias se utilizaron para realizar su
digestión in silico con 62 enzimas en el servi-
dor NEBcutter (Vincze-Tamas et al., 2003)
y se identificaron a las especies mediante
los diferentes tamaños de bandas generados
por la actividad enzimática. Resultados y
discusión. La digestión enzimática generó
diferentes tamaños de bandas que poseen varia-
ción suficiente como para diferenciar entre las
diferentes especies de Xyleborus ya presentes
en el país, incluyendo X. glabratus. Dos enzi-
mas permitieron discriminar entre las especies
ya presentes en México y X. glabratus, mien-
tras que seis permitieron discriminar solamente
entre las diferentes especies previamente repor-
tadas en México. Conclusión. La digestión
enzimática tiene potencial como herramienta
de apoyo para distinguir especies que forman
complejos crípticos cuya identificación morfo-
lógica es compleja, sin la necesidad de recurrir
a la secuenciación completa de fragmentos de
ADN que supone mayor costo y tiempo.
Palabras clave
Cox, aguacate, escarabajos, ambrosiales, iden-
tificación.
for the identification of the different species of
Xyleborus distributed in Mexico. Methods.
Sequences of Xyleborus species available in
databases were downloaded, and then, we
performed there in silico digestion with 62
enzymes using the NEBcutter server (Vinc-
ze-Tamas et al., 2003) to test if the banding
pattern generated by the enzymatic activity
was enough to discriminate among species.
Results and discussion. The enzymatic
digestion generated banding patterns useful
to discriminate among the Xyleborus species
present in Mexico, including the quaranti-
ne species X. glabratus. Two enzymes were
useful to discriminate among the species re-
ported in Mexico and X. glabratus, while six
allowed the discrimination of only the species
reported in Mexico. Conclusion. enzymatic
digestion has the potential as a support tool
to discriminate species forming cryptic com-
plexes whose morphological identification is
complicated, without the need to sequence
fragments of DNA which has high economic
and timing costs.
Keywords
Cox, avocado, ambrosia, beetles, identification.
Literatura citada
Castrejón-Antonio, J.E.; Montesinos-Matías, R.; Acevedo-Reyes, N.; Tamez-Guerra, P.; Ayala-Zermeño,
M.Á.; Berlanga-Padilla, A.M. y Arredondo-Bernal, H.C. (2017). Especies de Xyleborus (Coleop-
tera: Curculionidae: Scolytinae) asociados a huertos de aguacate en Colima, México. Acta Zoológica
Mexicana. 33(1): 146-150.
Pérez-De La Cruz, M.; Equihua-Martínez, A.; Romero-Nápoles, J.; Valdez-Carrasco, J. y De La Cruz-
Pérez, A. (2009). Claves para la identificación de escolitinos (Coleóptera: Curculionidae: Scolytinae)
asociados al agroecosistema cacao en el sur de México. Boletín del Museo de Entomología de la Univer-
sidad del Valle. 10(1): 14-29.
Vincze, T.; Posfai, J. y Roberts, R.J. (2003). NEBcutter: A program to cleave DNA with restriction en-
zymes. Nucleic Acids Research. 31(13): 3688-3691. DOI: 10.1093/nar/gkg526. PMID: 12824395;
PMCID: PMC168933.
